Ubicado al norte del Estado colinda al norte con los Estados Unidos de Norte América, al este con el Municipio de Cananea, al sur con Ímuris y al oeste con Nogales.

Cuenta con una superficie de 1,017.08 kilómetros cuadrados, su topografía la constituyen zonas accidentadas que representan el 40% de la superficie territorial, que equivale a 407.07 kilómetros cuadrados; este tipo de suelo se localiza al este y oeste del municipio y está formado por montañas de 1,530 metros sobre el nivel del mar, tales como la sierra de San Antonio y la sierra del Chivato.

Historia

El terreno donde se levanta la población fue ocupado desde mediados del siglo XVII por Juan Munguía Villela, que entró a la región con el conquistador Pedro de Perea en 1637.

Juan Munguía Villela llegó a ser alcalde mayor de la provincia de Sonora y fue el primer poblador del actual pueblo de Santa Cruz, dedicándose a la agricultura y a la minería.

En 1775 se cambió ahí la base del presidio militar de Terrenate por orden del coronel Hugo de Oconor, inspector general de presidios.
El 13 de mayo de 1931 Santa cruz alcanza el rango de municipio.

Actualidad

Agricultura  es una de las actividades más importantes, desarrollándose en 1,211.0 hectáreas, de las cuales 888 son de riego y 333 de temporal. Del total de hectáreas 734.5 son de propiedad ejidal y 486.5 pertenecen a pequeños propietarios. Los principales cultivos son hortalizas y manzana y en menor medida maíz y frijol.

Ganadería la actividad ganadera que se desarrolla en el municipio es en una superficie de agostadero de 77,605 hectáreas, en ésta se estima una población de 15,550 cabezas de ganado de las cuales 8,725 corresponden al sector ejidal y 6,825 cabezas al sector privado.

La infraestructura hidráulica en apoyo a la ganadería lo componen 90 represos; 10 pozos de abrevadero y 65 hectáreas de praderas artificiales; 40 de ellas son del sistema ejidal y 25 de pequeños propietarios.